MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009468	ACC	2	6	111904	111909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243903
2002	NC_009468	GC	3	6	111918	111923	0 %	0 %	50 %	50 %	148243903
2003	NC_009468	ACG	2	6	112024	112029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243903
2004	NC_009468	CGCC	2	8	112147	112154	0 %	0 %	25 %	75 %	148243903
2005	NC_009468	TTC	2	6	112176	112181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243903
2006	NC_009468	CTT	2	6	112200	112205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243903
2007	NC_009468	AGC	2	6	112234	112239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243903
2008	NC_009468	CAT	2	6	112310	112315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243903
2009	NC_009468	GCG	2	6	112320	112325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243903
2010	NC_009468	GCCC	2	8	112457	112464	0 %	0 %	25 %	75 %	148243903
2011	NC_009468	CGG	3	9	112611	112619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243904
2012	NC_009468	GTG	2	6	112635	112640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243904
2013	NC_009468	GCC	2	6	112658	112663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243904
2014	NC_009468	TGC	2	6	112686	112691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243904
2015	NC_009468	TCA	2	6	112697	112702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243904
2016	NC_009468	TCT	2	6	112712	112717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243904
2017	NC_009468	ACG	2	6	112732	112737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243904
2018	NC_009468	AGA	2	6	112783	112788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243904
2019	NC_009468	GAT	2	6	112791	112796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243904
2020	NC_009468	GGC	2	6	112820	112825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243904
2021	NC_009468	CGA	2	6	112834	112839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243904
2022	NC_009468	GGA	2	6	112862	112867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243904
2023	NC_009468	ACGG	2	8	112919	112926	25 %	0 %	50 %	25 %	148243904
2024	NC_009468	GCGA	2	8	112943	112950	25 %	0 %	50 %	25 %	148243904
2025	NC_009468	CGC	2	6	113056	113061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243904
2026	NC_009468	CGG	2	6	113112	113117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243904
2027	NC_009468	TCGC	2	8	113143	113150	0 %	25 %	25 %	50 %	148243904
2028	NC_009468	CG	3	6	113152	113157	0 %	0 %	50 %	50 %	148243904
2029	NC_009468	TGA	2	6	113203	113208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243904
2030	NC_009468	TGC	2	6	113270	113275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243904
2031	NC_009468	AGG	2	6	113309	113314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243904
2032	NC_009468	CAA	2	6	113348	113353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243904
2033	NC_009468	GCT	2	6	113366	113371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243904
2034	NC_009468	CGC	2	6	113387	113392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243904
2035	NC_009468	CGC	2	6	113419	113424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243904
2036	NC_009468	CGG	2	6	113426	113431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243904
2037	NC_009468	GGGC	2	8	113811	113818	0 %	0 %	75 %	25 %	148243905
2038	NC_009468	GCC	2	6	113918	113923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243905
2039	NC_009468	CCG	2	6	113944	113949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243905
2040	NC_009468	CCG	2	6	114008	114013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243905
2041	NC_009468	GAT	2	6	114048	114053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243905
2042	NC_009468	GGC	2	6	115045	115050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243906
2043	NC_009468	CAA	2	6	115081	115086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243906
2044	NC_009468	AAT	2	6	115106	115111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243906
2045	NC_009468	GC	3	6	115118	115123	0 %	0 %	50 %	50 %	148243906
2046	NC_009468	GCAG	2	8	115159	115166	25 %	0 %	50 %	25 %	148243906
2047	NC_009468	GCG	2	6	115253	115258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243906
2048	NC_009468	GGAGAT	2	12	115275	115286	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148243906
2049	NC_009468	TGC	2	6	115341	115346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243906
2050	NC_009468	CAT	2	6	115351	115356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243906
2051	NC_009468	TAG	2	6	115396	115401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243906
2052	NC_009468	GC	3	6	115478	115483	0 %	0 %	50 %	50 %	148243906
2053	NC_009468	TCG	2	6	115518	115523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243906
2054	NC_009468	TCG	2	6	115526	115531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243906
2055	NC_009468	CAGTC	2	10	115536	115545	20 %	20 %	20 %	40 %	148243906
2056	NC_009468	CGC	2	6	115588	115593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243906
2057	NC_009468	ACG	3	9	115596	115604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243906
2058	NC_009468	CAC	2	6	115609	115614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243906
2059	NC_009468	CGTCC	2	10	115657	115666	0 %	20 %	20 %	60 %	148243906
2060	NC_009468	ATTC	2	8	115683	115690	25 %	50 %	0 %	25 %	148243906
2061	NC_009468	TAC	2	6	115704	115709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243906
2062	NC_009468	TA	3	6	115735	115740	50 %	50 %	0 %	0 %	148243906
2063	NC_009468	GGT	2	6	115813	115818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243906
2064	NC_009468	TCCGC	2	10	115823	115832	0 %	20 %	20 %	60 %	148243906
2065	NC_009468	GCA	2	6	115839	115844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243906
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2068	NC_009468	GAT	2	6	115918	115923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243906
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2070	NC_009468	GCC	2	6	115948	115953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243906
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2073	NC_009468	CGA	2	6	116223	116228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243907
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2087	NC_009468	TCG	2	6	117364	117369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243909
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2109	NC_009468	ACG	2	6	118110	118115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243909
2110	NC_009468	CG	3	6	118166	118171	0 %	0 %	50 %	50 %	148243909
2111	NC_009468	GTCG	2	8	118202	118209	0 %	25 %	50 %	25 %	148243909
2112	NC_009468	CGC	2	6	118319	118324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243909
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2120	NC_009468	CTGG	2	8	118831	118838	0 %	25 %	50 %	25 %	148243910
2121	NC_009468	TGA	2	6	118867	118872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243910
2122	NC_009468	GC	4	8	118891	118898	0 %	0 %	50 %	50 %	148243910
2123	NC_009468	ACTCGC	2	12	118915	118926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243910
2124	NC_009468	GGC	2	6	118938	118943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243910
2125	NC_009468	GAT	2	6	118951	118956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243910
2126	NC_009468	CTG	2	6	118979	118984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243910
2127	NC_009468	CGA	2	6	118990	118995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243910
2128	NC_009468	TCG	2	6	119046	119051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243910
2129	NC_009468	CCA	2	6	119073	119078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243910
2130	NC_009468	TCA	2	6	119079	119084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243910
2131	NC_009468	CCAG	2	8	119085	119092	25 %	0 %	25 %	50 %	148243910
2132	NC_009468	GCAA	2	8	119214	119221	50 %	0 %	25 %	25 %	148243910
2133	NC_009468	CTT	2	6	120048	120053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243911
2134	NC_009468	CAG	2	6	120092	120097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243911
2135	NC_009468	CAT	2	6	120128	120133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243911
2136	NC_009468	TGA	2	6	120170	120175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243911
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2138	NC_009468	GGC	2	6	120225	120230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243911
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2141	NC_009468	CGC	2	6	120502	120507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243912
2142	NC_009468	ACG	2	6	120526	120531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243912
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2144	NC_009468	GC	3	6	120620	120625	0 %	0 %	50 %	50 %	148243912
2145	NC_009468	GCT	2	6	120671	120676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243912
2146	NC_009468	CTG	2	6	120714	120719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243912
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2151	NC_009468	AAC	2	6	120905	120910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243912
2152	NC_009468	AC	3	6	120909	120914	50 %	0 %	0 %	50 %	148243912
2153	NC_009468	GGC	2	6	120919	120924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243912
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2155	NC_009468	GTC	2	6	120949	120954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243912
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2159	NC_009468	GGCC	2	8	121002	121009	0 %	0 %	50 %	50 %	148243912
2160	NC_009468	AGAT	2	8	121028	121035	50 %	25 %	25 %	0 %	148243912
2161	NC_009468	TGC	2	6	121119	121124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243912
2162	NC_009468	CGG	2	6	121127	121132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243912
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2166	NC_009468	GGC	2	6	122080	122085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243913
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2172	NC_009468	CG	3	6	122378	122383	0 %	0 %	50 %	50 %	148243913
2173	NC_009468	CGCA	2	8	122413	122420	25 %	0 %	25 %	50 %	148243913
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2213	NC_009468	GCT	2	6	123816	123821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243915
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2223	NC_009468	AT	3	6	124341	124346	50 %	50 %	0 %	0 %	148243916
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2225	NC_009468	T	6	6	124382	124387	0 %	100 %	0 %	0 %	148243916
2226	NC_009468	GCC	2	6	124402	124407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243916
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2230	NC_009468	GGCC	2	8	124457	124464	0 %	0 %	50 %	50 %	148243916
2231	NC_009468	CGGC	2	8	124504	124511	0 %	0 %	50 %	50 %	148243916
2232	NC_009468	GCT	2	6	124555	124560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243916
2233	NC_009468	GCT	2	6	124609	124614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243916
2234	NC_009468	TGC	2	6	124617	124622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243916
2235	NC_009468	CGG	2	6	124648	124653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243916
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2237	NC_009468	CGG	2	6	124717	124722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243916
2238	NC_009468	CGC	2	6	124732	124737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243916
2239	NC_009468	CGGCG	2	10	124855	124864	0 %	0 %	60 %	40 %	148243916
2240	NC_009468	CTG	2	6	124994	124999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243916
2241	NC_009468	TGC	2	6	125004	125009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243916
2242	NC_009468	TGA	2	6	125013	125018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243916
2243	NC_009468	ACT	2	6	125116	125121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243916
2244	NC_009468	TTC	2	6	125141	125146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243916
2245	NC_009468	CGG	2	6	125186	125191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243916
2246	NC_009468	GCG	2	6	125234	125239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243916
2247	NC_009468	ATGT	2	8	125243	125250	25 %	50 %	25 %	0 %	148243916
2248	NC_009468	GAT	2	6	125281	125286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243916
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2250	NC_009468	TCA	2	6	125415	125420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243916
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2252	NC_009468	CGG	2	6	125503	125508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243916
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2254	NC_009468	GAG	2	6	125565	125570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243916
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2256	NC_009468	AT	3	6	125637	125642	50 %	50 %	0 %	0 %	148243917
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2260	NC_009468	ACGC	2	8	125853	125860	25 %	0 %	25 %	50 %	148243917
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2264	NC_009468	CCGG	2	8	126059	126066	0 %	0 %	50 %	50 %	148243917
2265	NC_009468	TCG	2	6	126150	126155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243917
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2281	NC_009468	TCG	2	6	126780	126785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243918
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2317	NC_009468	TCG	2	6	127903	127908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243919
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2349	NC_009468	GC	3	6	129752	129757	0 %	0 %	50 %	50 %	148243922
2350	NC_009468	GAA	2	6	129767	129772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243922
2351	NC_009468	CAG	2	6	130023	130028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243923
2352	NC_009468	TGC	2	6	130033	130038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243923
2353	NC_009468	GCC	2	6	130203	130208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243923
2354	NC_009468	ATC	2	6	130439	130444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243924
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2356	NC_009468	GGC	2	6	130556	130561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243924
2357	NC_009468	TGG	2	6	130626	130631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243924
2358	NC_009468	TGTC	2	8	130733	130740	0 %	50 %	25 %	25 %	148243925
2359	NC_009468	GCG	2	6	130746	130751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243925
2360	NC_009468	ATCG	2	8	130775	130782	25 %	25 %	25 %	25 %	148243925
2361	NC_009468	GGC	2	6	130818	130823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243925
2362	NC_009468	CAT	2	6	130836	130841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243925
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2364	NC_009468	TGC	2	6	130892	130897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243925
2365	NC_009468	GGC	2	6	130943	130948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243925
2366	NC_009468	TG	3	6	131046	131051	0 %	50 %	50 %	0 %	148243925
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2485	NC_009468	TCG	2	6	136874	136879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243931
2486	NC_009468	TCG	2	6	136903	136908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243931
2487	NC_009468	CCT	2	6	136929	136934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243931
2488	NC_009468	GATCG	2	10	136965	136974	20 %	20 %	40 %	20 %	148243931
2489	NC_009468	AGC	2	6	137098	137103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243931
2490	NC_009468	CCA	2	6	137111	137116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243931
2491	NC_009468	CGC	2	6	137169	137174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243931
2492	NC_009468	CGG	2	6	137202	137207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243931
2493	NC_009468	TCA	2	6	137252	137257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243931
2494	NC_009468	CAC	2	6	137291	137296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243931
2495	NC_009468	TGC	2	6	137333	137338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243931
2496	NC_009468	GC	3	6	137358	137363	0 %	0 %	50 %	50 %	148243931
2497	NC_009468	GC	3	6	137399	137404	0 %	0 %	50 %	50 %	148243931
2498	NC_009468	GCG	2	6	137471	137476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243931
2499	NC_009468	TTG	2	6	137503	137508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243931
2500	NC_009468	TCA	3	9	137513	137521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243931

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